Τα Ανώγεια απέχουν 52 χιλιόμετρα απο το Ρέθυμνο , 36 χιλιόμετρα απο το Ηράκλειο και βρίσκονται 800 μέτρα στην ράχη του υψώματος που ονομάζεται Αρμί.
Τα Ανώγεια βρίσκονται 36 χιλιόμετρα μακρυά απο το Ηράκλειο και 52 χιλιόμετρα μακρυά απο το Ρέθυμνο, σε υψόμετρο 800 μέτρων. Είναι κτισμένα στη κορυφογραμμή του υψώματος Αρμί του Ψηλορείτη, δηλαδή σε ψηλό (ή ανώγειο) μέρος. Τα Ανώγεια έχουν ιδιαίτερα στενή σχέση με τον Ψηλορείτη και τα ορεινά του τοπία. Θεωρούνται το επίκεντρο του σύγχρονου Κρητικού πολιτισμού. Οι κάτοικοι των Ανωγείων φαίνεται ότι απολαμβάνουν την κάθε στιγμή της ζωής τους και δεν διστάζουν να εκφράσουν την χαρά τους , ενώ η προσβολή της τιμής τους μπορεί να γίνει λόγος να βγουν τα όπλα. Από την περιοχή αυτή κατάγονται οικογένειες με σημαντική προσφορά στην Κρητική και στην ευρύτερη Ελληνική παράδοση.
Δέκα χιλιόμετρα από τα Ανώγεια, σε υψόμετρο 1300 μέτρων , βρίσκεται η ονομαστή πηγή Ζώμινθος, με πλούσια ύδατα, η οποία αποτελεί και την κυριότερη πηγή για τα Ανώγεια. Δυτικά του χωριού βρίσκεται ο αρχαιολογικός χώρος της Ζωμίνθου .